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MASTER BIO-INFORMATIQUE Parcours Méthodes informatiques et statistiques pour les OMICS

  • Durée: 4 semestre(s)
  • Accessible en: Formation initiale , Formation continue
  • Stage: OBLIGATOIRE(S4)
  • Niveau de diplôme requis à l'entrée: BAC+3
  • Niveau de diplôme validé à la sortie: BAC+5
  • N°RNCP: RNCP34129
  • Campus: Site Cité Scientifique - Villeneuve d'Ascq
  • 20240417

Objectifs de la formation

Le parcours Méthodes informatiques et statistiques pour les omics (MISO) du master Bioinformatique apporte des compétences de haut niveau dans le domaine de la bioinformatique et de la biostatistique. Ce parcours est dédié aux étudiants et étudiants souhaitant acquérir des compétences et se perfectionner en bioinformatique. Le parcours accueille aussi bien des personnes titulaires d’une licence de biologie que d’informatique ou de mathématique. Certains enseignements seront spécifiques selon la filière d’origine de l’étudiant-e.

En étroite liaison avec les équipes de recherche de bioinformatique et biostatistique de l’université de Lille ainsi qu’avec la plateforme lilloise de bioinformatique et biostatistique, le parcours vise à faire découvrir progressivement et à permettre la maîtrise des méthodes informatiques et statistiques utilisées pour l’analyse informatique et statistique de données biologiques. Les quantités de données produites nécessitent des outils spécifiques pour l’analyse de données génomiques, de réseaux métaboliques, etc.

Spécificités de la formation

  • Le parcours MISO est adossé à des équipes de recherche en bioinformatique et en biostatistique. Les intervenantes et intervenants du master sont activement impliqués dans la recherche en biologie, en bioinformatique ou en biostatistique.
  • Ce parcours se fait également en partenariat avec Bilille, la plateforme de bioinformatique et biostatistique lilloise qui répond aux demandes d’ingénierie bioinformatique des laboratoires de recherche lillois. Durant le cursus un projet sera à mener, en collaboration avec des ingénieur-e-s de la plateforme. Un autre projet, proposé par les laboratoires de l’université de Lille, portera sur des aspects de développement bioinformatique. Le cursus se termine pas un stage de 6 mois.
  • Le parcours MISO a été pensé pour intégrer des étudiant-e-s de cursus différents (biologie, informatique, mathématique). Certaines des matières dépendront du cursus initial des étudiant-e-s.

Compétences visées

L’analyse de données biologiques (génomiques, protéomiques, réseaux métaboliques, …) toujours plus abondantes est rendue possible par des méthodes informatiques et statistiques toujours plus efficaces. L’objectif de MISO est d’appréhender ces méthodes, de les utiliser, de se familiariser avec pour l’étude de données biologiques. Le parcours MISO se divise en trois blocs de compétence : bioinformatique, biostatistique et informatique.

  • bioinformatique : savoir choisir, installer, utiliser et paramétrer des outils bioinformatiques adaptés à une question donnée, savoir interpréter les résultats obtenus et avoir un recul critique sur ceux-ci.
  • biostatistique : connaître et savoir utiliser des analyses statistiques, savoir choisir un modèle adapté, pouvoir mettre en oeuvre des analyses statististiques avec R.
  • informatique : savoir mettre en oeuvre un algorithme bioinformatique en faisant des choix adaptés, savoir mettre en place des bases de données.

Modalités d'admission/ Conditions d'accès

EN MASTER 1

L'admission en première année de master est subordonnée à l'examen du dossier du candidat / de la candidate selon les modalités suivantes :

Formation ouverte au recrutement : Oui

Capacité d'accueil : 26 places

Langues vivantes enseignées :

  • Anglais

Mentions de licence conseillée :

  • Sciences pour la santé
  • Sciences pour l'ingénieur
  • Informatique
  • Sciences de la vie

Campagne de recrutement nationale:

  • Dépôt des candidature du 26/02/24 au 24/03/24 inclus / Phase principale d'admission : du 04 au 24/06/24
  • Phase complémentaire ouverte à tous les candidat·es qui n’auront pas accepté définitivement une proposition pendant la phase principale : du 25 au 30/06/24
  • Phase d'admission définitive du 15/07 au 31/07/24

Modalités de candidature :

  • Dossier
  • Entretien

Attendus :

  • Avoir une expérience de la programmation informatique
  • Avoir un intérêt démontré pour la biologie

Critères d'examen du dossier:

  • Parcours de Licence
  • Notes de Licence
  • Notes en informatique, biostatistique
  • Niveau Anglais
  • Réalisation de stages
  • Motivation
  • Parcours personnel

Pièces spécifiques :

Eventuellement : lettre de recommandation des encadrants de stage

Déposez votre candidature en suivant ce lien https://monmaster.gouv.fr

EN MASTER 2

L’accès est de droit en master 2 pour les étudiant·e·s ayant validé le master 1 correspondant à l'université de Lille.
Les candidat·e·s issu·e·s d'une autre mention, d'un autre parcours de la mention ou d'un autre établissement d'enseignement supérieur doivent formuler une demande d'intégration selon les modalités suivantes :

Formation ouverte au recrutement : Oui

Capacité d'accueil : 19 places

Langues vivantes enseignées :

  • Anglais

Campagne de recrutement principale:
  • Date d’ouverture du recrutement : 20240412
  • Date de fermeture : 20240606
  • Date publication des résultats : 20240613

Déposez votre candidature sur la plateforme Ecandidat de l'université de Lille https://ecandidat.univ-lille.fr

Modalités d’examen des dossiers basées sur les pièces suivantes :

La lettre de demande d'intégration présentant le projet professionnel et personnel de recherche.
Les relevés de notes du Master1 (qui pourront être complétés au besoin par le programme détaillé des UE).

Attendus :

Dossier et éventuellement entretien téléphonique

Organisation de la formation

  • Le parcours Méthodes informatiques et statistiques pour les omics (MISO) est organisé autour de quatre blocs de connaissances et de compétences (BCC) :
    • BCC1 - BIOINFORMATIQUE
    • BCC2 - BIOSTATISTIQUE
    • BCC3 - INFORMATIQUE
    • BCC4 - PROFESSIONNALISATION
  • Stage de 6 mois au S4.

Programme

UE 1 Machine Learning 6 crédit(s)
UE 2 Option informatique 2 3 crédit(s)
UE 1 Génomique Evolutive 3 crédit(s)
UE 3 Protéomique et Métabolomique 3 crédit(s)
UE 1 Qualité et pré-traitement des données de santé 3 crédit(s)
UE 2 Recherche clinique 3 crédit(s)
UE 3 Systems biology and differential analyses 3 crédit(s)
UE 1 Technical bibliographic report 3 crédit(s)
UE Projet de l'étudiant 3 crédit(s)
UE 1 Biologie Computationnelle de Systèmes 3 crédit(s)
UE 2 Bioinformatique Structurale 3 crédit(s)
UE 1 Projet de fin d'études 3 crédit(s)
UE 3 Stage 21 crédit(s)

Poursuite d'études

Des doctorats dans le domaine de la bioinformatique sont possibles. Des offres sont chaque année disponibles dans la région mais aussi en France (voir par exemple https://frama.link/these-bioinfo) ou à l’étranger.

Insertion professionnelle

  • La bioinformatique est un domaine qui recrute à la fois dans le public et dans le privé.
  • La formation permet une insertion professionnelle à la sortie du master (sur des postes d’ingénieur) ou d’envisager un doctorat pour ensuite intégrer le public ou le privé.
  • Les domaines de l’agronomie, de la santé, des biotechnologies sont particulièrement demandeurs de compétences dans les domaines étudiés durant le parcours MISO.

Retrouvez les études et enquêtes de l’ODiF (Observatoire de la Direction de la Formation) sur l’insertion professionnelle des diplômés de la licence sur : https://odif.univ-lille.fr.

FACULTE DES SCIENCES ET TECHNOLOGIES


Université de Lille I Campus Cité scientifique
1er étage - Bât. faculté des sciences et technologies
59655 Villeneuve-d'Ascq
https://sciences-technologies.univ-lille.fr/

DEPARTEMENT BIOLOGIE


Université de Lille I Campus Cité scientifique
Bâtiment SN3
59655 Villeneuve-d'Ascq

Secrétariat Pédagogique


DOUAL Sylvie
+33 (0)3 20 43 45 09

Responsable Parcours


LEGRAND Sylvain

Responsable Parcours


SALSON Mikael

Responsable Mention


SALZET Michel

Responsable Mention


VERSARI Cristian